«اندیشه‌های پنهان: رویکرد سیستمی به حیات معنوی انسان» کتابی نوشته علاء الدین اسکندری درباره آثار استاد علی صفایی حائری است. این کتاب همچون کتابی راهنما در کنار آثار استاد صفایی، نظام و ترکیبی که در آثار استاد وجود دارد را توضیح داده است و درواقع شرحی است بر محورهای آثار ایشان.