باغ مخفی داستان دخترکی است به نام مری. مری را هیچ کس نمی‌خواست و دوست نداشت. بعد از مرگ والدین و دایه اش، او را از هند به انگلستان آوردند تا در خانه‌ی عمویش زندگی کند؛ خانه‌ای غمگین و ساکت. روزی هنگام پرسه زدن در باغ، به دیوارهای بلندی برمی‌خورد که گویی هیچ راهی برای ورود به آنجا نیست. کسی به باغ پشت دیوارها دسترسی ندارد، امّا اینکه مری چگونه می‌تواند داخل باغ اسرار آمیز شود و چه اتفاقی برایش می‌افتد، نوعی تردستی یا جادو یا شاید معجزه است. معجزه‌ای که هنوز هم دارد اتفاق می‌افتد. سال‌ها از نوشتن این کتاب می‌گذرد. کودکانی که آن را خوانده‌اند شاید دیگر مادربزرگ و پدربزرگ شده اند، اما این داستان معجزه هرگز تمام نشده است.